南平市博物馆现为地区级国立综合性博物馆，1984年开始筹建，1986年10月正式开馆，1994年南平撤地改市，原南平市改为延平区，南平市博物馆同时升格为地级馆。原址位于南平市新华路4号，馆舍面积600平方米。

　　南平市博物馆新馆位于南平市马坑路266号，占地面积4171平方米，建筑面积6368平方米。2005年开工建设， 2011年11月28日新馆开馆并免费开放。区域划分及功能：博物馆新馆共七层，其中：负一楼为临时综合展厅，其中展厅面积约1200平方米；一层为精品文物临展厅，其中展厅面积550平方米；二至四楼为基本陈列展厅，合计展厅面积2200平方米，用于《闽北五千年》基本陈列展览；五楼为文物库房及业务用房；六楼为学术报告厅。南平市博物馆现有藏品6326件/套，其中珍贵文物数量为2105件/套（一级文物2件/套，二级文物45件/套，三级文物2058件/套），一般文物3305件/套，其它藏品916件/套。有历代陶瓷精品、古钱币、玉器、字画、铁器、青铜器、文房四宝、木古雕等。其中原馆藏珍品“郑和铜钟”现已被中国国家博物馆收藏并展出。

　　近年来，南平市博物馆先后被授予“福建省二级博物馆”、“福建省国防教育基地”、“福建省爱国主义教育基地”、 “福建省全民国防教育先进单位”、“南平市爱国主义教育基地”、“南平市精神文明单位”、“南平市党员优质服务示范窗口”、“厦门大学文物与博物馆学闽北实习基地”、“延平区青少年德育基地”、“国家二级博物馆”等荣誉称号。

　　南平市博物馆现有的经费主要来源有国家免费开放专项经费，省级专项补助经费，市级财政给予的运行专项经费，这些财政拨款基本保障了博物馆的免费开放运行。

　　上级给予经费主要用于以下几个方面：博物馆馆舍维护、免费开放运营、举办临时展览、文物征集和保护、田野考古、专业人员培养等方面。

　　2011年11月28日举办南平市博物馆新馆正式开馆。原福建省文物局局长郑国珍、福建省博物院院长吴志跃、南平市人大主任兰斯文（原市委常委宣传部长）、南平市人民政府副市长刘亚圣等省、市领导以及各县（市、区）文体局局长、博物馆馆长出席开馆仪式；

　　2012年6月南平市博物馆被南平市委宣传部评为“南平市爱国主义教育基地”；

　　2013年6月南平市博物馆被南平市直机关工委评为“第三批党员优质服务示范窗口”；

　　2014年5月南平市博物馆与厦门大学历史学院合作成立“厦门大学文物与博物馆学闽北实习基地”；

　　2014年11月被福建省国防教育联席会议评为“福建省全民国防教育先进单位”；

　　2014年10月南平市博物馆与青海省柳湾彩陶博物馆合作，首次引进省外精品展《江河源人类史前文明青海柳湾彩陶展》。

　　2014年12月南平市博物馆馆长王世亮通过文博研究员职称评定，成为我馆历史上首位正高级研究员。

　　2015年8月被南平市委、市政府评为“南平市第十二届（2012-2014年度）文明单位”。

　　2018年1月，被福建省人社厅 福建省文化厅授予“2013-2016年度全省文化系统先进集体”。

　　2018年8月，被南平市委、市政府评为“南平市第十三届（2015-2017年度）文明单位”。

　　2019年10月，南平市博物馆与福建省昙石山遗址博物馆共同划策的《见盏寻味千年造盏工艺》展荣获庆祝中华人民共和国成立70周年福建文博系列（2009-2019年度）成果评审推介活动“福建陈列展览最佳创意奖”。

　　2019年12月，南平市博物馆建盏系列文创产品“花扇（建盏系列扇）”荣获第六届（2019）福建文创奖文博创意产品类铜奖。